MEGA6: Constructing a Phylogenetic Tree on Multiple Sequences

使用BioEdit生成和绘制蛋白质进化树  虽然方法简单、上手快,但是由于 BioEdit 功能有限,使用起来很不方便。如果经常进行类似分析,那还是要使用 MEGA 6 这一个系统进化分析的“大杀器”。

第一步:下载和安装 MEGA 6。各平台均有发行版,在此不再赘述。

第二步:多序列比对,这是构建系统进化树的必要条件。

点击第一个按钮,选择 Edit/Build Alignment。
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正如题目所说的,我们需要选择一个含有多个序列的 Fasta 文件。
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从菜单选择 Alignment – Align By xxx 如果序列比较多,那比对需要花上一些时间。

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第三步:进化分析。
在比对完成的窗口中直接选择 Phylogenetic Analysis。
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第四步:构建进化树。
在主窗口页面上点击 Phylogeny 这个按钮,选择一种方法构建进化树,
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点击 Compute 开始计算。
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现在你将得到你所需要的进化树了。
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One Response to “MEGA6: Constructing a Phylogenetic Tree on Multiple Sequences”

  1. […] 使用BioEdit可以方便的生成和绘制进化树。(另请参考:进化树大杀器MEGA的使用) […]

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